院內感染是指在住院期間得到的感染。但不包括入院即有的或潛伏的感染。如潛伏期不明時，入院后發生的任何感染皆可稱為院內感染。院內感染的成因：
1. 交互感染。
2. 侵入性的醫療措施。
3. 病患抵抗能力的下降。
4. 抗生素的濫用。
院內感染，不僅影響就醫病患及醫院工作人員的健康，也造成醫療資源的浪費,依據CDC的統計，美國醫院加護中心每年的院內感染發生機率約在千分之五至千分之十四左右，死亡率為百分之四點五，以此推估，每年因醫院內感染而死亡的人數約為九萬人，,耗費的醫療成本約為四十五億美元。臺灣地區九十年醫學中心加護中心的院內感染密度亦在千分之五至千分之二十左右，死亡率及醫療成本則仍在估算中。國內區域級以上醫院雖已采用美國疾病及管制中心的院內感染監督系統，由感染控制護士及有關負責人員例行收集院內感染和致病菌株分布的統計資料，但是這些數據都未能提出抗藥性細菌的全面感染行程及其散播的原因，以致院內感染的起因與形成無法明了而達到及時控制。
醫院因環境特殊、病患集中與使用各種抗生素等原因， 病患于就醫時于院內得到尿路感染、血液感染、呼吸道感染、手術部位感染、及其它部位感染。
近代的感染控制有長遠的進步,但仍無法降低手術部位感染的罹患率及死亡率,其原因可能是抗藥性菌種增加、越多年老且有多項宿疾病患也接受手術,另一方面是移入物手術增加。
